В центре научных интересов Каунова А.М. являются вопросы разработки импульсных и комбинированных технологий создания алмазсодержащего сырья, порошков алмазов, новых типов синтезированных и композиционных материалов и покрытий различного функционального назначения, а также вопросы решения проблемы с использованием инновационных технологий и методов обучения и формирования личностно-профессиональных компетенций будущего специалиста в процессе подготовки бакалавров, учителей и магистров по специальности «Технология и предпринимательство». Под его руководством работает аспирантура по специальностям «Материаловедение» (машиностроение) и «Теория и методика обучения и воспитания (технологии)» и магистратура по специальности «Технологическое образование».